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原告Xは、T大学大学院教授で日本病理学会副理事長である。
被告Yは、独立行政法人放射線医学総合研究所重粒子医科学センター病院勤務の病理専門の医学博士で、海堂尊のペンネームをもつ作家でもある。

Xは、社団法人内科学会が平成１７年９月１日から厚生労働祥補助事業として実施の「診療行為に関連した死亡の調査分析モデル事業」に関与していたが、平成２０年度科学研究費補助金で、研究課題「『診療行為に関連した死亡の調査分析』における解剖を補助する死因究明手法の検証に関する研究」の募集に応じ採択された。応募はXのみであった。
Yは、海堂尊の名前で、(株)日経ビーピー社が運営する「日経メデイカルオンライン」というサイト（医師限定のサイト）内で、「Aiめぐる生臭い話」などの記事を掲載した。
また、Yは、(株)宝島社が運営する「『このミス』大賞受賞作家･海堂尊のホームページ・宝島社」サイト内に「学会上層部と官僚の癒着による学術業績剽窃事件」と題する記事を掲載した。

Xは、Yに対して、これらの記事により、Xの名誉を毀損されたとして、３３０万円（慰謝料３００万円、弁護士費用３０万円）を求めて訴えた。
Yは、記事の摘示した事実は、真実であり、また公正な論評であると主張し、争った。
東京地裁民事５部（畠山稔裁判長、熊谷光喜､折田恭子裁判官）は、日経ビーピーのサイトの記事１と宝島社のサイトの記事２を合わせて、これを、別紙とし、「No.１」部分を、「本件記述１」とし、本件記述１２まで、を順に、主張を並記し、検討した。

1. 本件記述１，２，４，５，６，７，８，９，はXの社会的評価を低下させるとした。
2. 本件記述３，４の摘示事実は、真実かどうかについて、真実と認める証拠はない、とした。
3. 本件記述１０，１１，１２は、公正な論評でないとした。
4. 原告は､精神的苦痛を被っており、本件記事１は、閲覧記事ランキング一位になり、多数の目にふれたこと、Xの社会的地位その他本件に現れた一切の事情を総合考慮し､慰謝料１００万円、弁護士費用１０万円、合計１１０万円の支払いをYに命じた。